✦ An 958 ✦
Ancien cobaye de laboratoire en cavale, Yaëlle ShimoHane décide de partir à la recherche de son ami d'enfance toujours entre les griffes de CRIEE, l'organisation qui lui a tout volé. Aux portes d'une guerre dévastatrice et d'événements qui la surpasse, la jeune fille va devoir se liguer contre toute une nation pour obtenir le droit d'exister.
✦ An 970 ✦
Après la chute de CRIEE, Yaëlle et ses compagnons cherchent désespérément à se reconstruire chacun de leur côté. Mais la réalité finie toujours par les rattraper : CRIEE n'est plus, mais Shimichi a survécu et est maintenant à la tête de l'Empire. Il est temps pour eux de prendre une dernière fois les armes pour forger leur nouvel avenir.
✦ An 938 ✦
Menant une existence de chasseur misérable, Kai Araii se remémore son enfance douloureuse. Le visage de son demi-frère, Noun, qu'il s'efforçait d'oublier depuis des années, semble revenir à la surface. Et avec lui, le souvenir d'une vieille boite en bois, sans serrure ni clef.
✦ An 714 ✦
Kato Tsukiteru, réceptacle du dieu de la Lune, subit de plein fouet la répression de son peuple par l'Empire Humain. Prenant peu à peu conscience qu'il pourrait changer la face du monde malgré son statut de Maudit, il se met en tête de rassembler une armée pour lutter contre l'oppression. Mais de sauveur à tyran, il n'y a qu'un pas...